質(zhì)譜儀是分離和檢測帶電物質(zhì)的質(zhì)量差異的一類儀器。離子化過程對質(zhì)譜檢測十分關鍵，只有將分析物變成帶電離子并轉(zhuǎn)移到氣相中，才能被質(zhì)譜儀檢測到。目前的離子化有ESI、MALDI、APCI和APPI。質(zhì)譜儀通常由離子源、真空接口、質(zhì)量分析器和檢測器組成。檢測器可分為磁質(zhì)譜、四極桿質(zhì)譜、離子阱質(zhì)譜、傅里葉回旋共振質(zhì)譜、飛行時間質(zhì)譜等。

四極桿質(zhì)譜儀是由四根精密加工的電極桿以及分別施加于x、y方向的兩組高壓高頻射頻組成的電場分析器，高壓高頻信號提供了離子在分析器中運動的輔助能量，這一能量是選擇性的，只有符合條件的離子才能夠不被無限制地加速，安全地通過四極桿分析器。

三重四極桿串聯(lián)質(zhì)譜儀是由兩個串聯(lián)的四極桿以及位于兩個四極桿中間的碰撞室組成的質(zhì)譜儀。di一個四極桿質(zhì)量分析器將待測物的離子進行di一級分離，被選定質(zhì)核比的離子離開di一個四極桿質(zhì)量分析器，在碰撞室中與惰性氣體碰撞裂解，產(chǎn)生一系列的新離子，新的二級離子進入第三個四極桿質(zhì)量分析器中被檢測。兩級質(zhì)量分析比單級所獲得的化學專屬性要高得多，能得到非常高的分析選擇性和靈敏度。

串聯(lián)四極桿混合離子阱質(zhì)譜儀是將三重四極桿質(zhì)譜儀中更后一級四極桿改為線性離子阱。離子阱（Ion trap），大致分為三維離子阱（3D Ion Trap）、線性離子阱（Linear Ion Trap）、軌道離子阱（Orbitrap）三種。

四極桿-飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜儀是將三重四極桿質(zhì)譜的第三重四極桿換成飛行時間質(zhì)譜。利用動能相同而質(zhì)核比不同的離子在恒定電場中運動，經(jīng)過恒定距離所需時間不同的原理對物質(zhì)成分或結(jié)構進行測定，屬于高分辨質(zhì)譜范疇，可以給出待測化合物精確的分子結(jié)構信息。